Cơ chế hoạt động của MGC bao gồm Hội nghị Bộ trưởng hàng năm (cùng lúc với Hội nghị Bộ trưởng ASEAN), Hội nghị các quan chức cấp cao, và 5 nhóm công tác là:

• Nhóm công tác về Du lịch (Thái Lan là nước dẫn đầu)
• Nhóm công tác về Giáo dục (Ấn Độ là nước dẫn đầu)
• Nhóm công tác về Văn hóa (Campuchia là nước dẫn đầu)
• Nhóm công tác về Truyền thông & Giao thông vận tải (Lào là nước dẫn đầu)
• Nhóm công tác về Kế hoạch Hành động (Việt Nam là nước dẫn đầu)